Rumah Api Tanjung Tuan: Melambangkan warisan sejarah dan budaya yang ikonik di Melaka. Rumah Api ini merupakan mercu tanda di Tanjung Tuan (Cape Rachado), salah satu geotapak utama dalam pembangunan geopark ini.
Latar Belakang Biru (Lautan/Air): Melambangkan warisan marin dan georintis sungai (seperti Sungai Rambai) serta potensi pulau-pulau di Melaka (Pulau Undan, Pulau Upeh, Pulau Besar) untuk diiktiraf sebagai Geopark Kebangsaan menjelang 2026.
Latar Belakang Hijau (Alam Sekitar/Flora): Mewakili biodiversiti dan pemeliharaan alam semulajadi yang mampan di kawasan geopark.
Bentuk Batuan (Geologi): Mewakili kekayaan geowarisan Melaka, termasuk pembentukan batuan unik seperti korok kuarza di Tanjung Tuan, laterit di Pulau Upeh, dan aplit di Pulau Besar.
Bentuk Kancil (Warna Hijau): Merupakan simbol tradisional negeri Melaka yang dikaitkan dengan sejarah pengasasan negeri oleh Parameswara. Dalam konteks logo ini, ia juga boleh ditafsirkan sebagai simbol kelestarian biodiversiti (Warisan Biologi).